No painel da hospedagem, selecione o site correto antes de abrir o gerenciador de arquivos. Faça uma cópia dos arquivos atuais antes de substituí-los e confira qual diretório está configurado como raiz do site.
Envie os arquivos da aplicação e confira permissões, arquivo inicial e configurações de conexão com o banco. Não exponha arquivos de configuração, cópias do banco ou credenciais em diretórios públicos.
Depois do envio, teste as páginas e os formulários. Solicite orientação pelo suporte se não souber qual pasta ou banco pertence ao site.